多數小兒癲癇部分性發作控制較好，得益於目前類型較多的抗癲癇藥物，效果不好時可以更換種類，甚至多藥聯合使用。藥物控制不好的患兒可以進一步檢查，30%的藥物難治性癲癇即使藥物控制不好，也可以通過手術的方法進行治療，比如病灶切除。

部分性發作較常見的原因是海綿狀血管瘤、低級別膠質瘤和皮層發育不良，將病灶進行切除之後，部分性發作能夠得到控制。即使有部分患兒發作，還可以通過改變藥物劑量和種類，使用多重藥物以及神經調控等其他方法進行治療。