尋常疣可以用物理治療，局部外用藥和系統用藥。

物理治療對少數散在的疣體可以刮除，較大的疣體可以做液氮冷凍，液氮的溫度為零下196℃，可以使病變細胞內外形成冰晶，細胞膜類脂蛋白變性，從而引起病變的細胞和組織死亡。一般每1-2周治療1次，多數疣體經過2-3次治療後可以消退。對液氮治療抵抗者可以用二氧化碳激光治療或者皮下注射0.05%-0.1%的博來黴素，每週注射1次。

藥物療法，可以外用腐蝕性的化學藥物，比如火棉膠或者鴉膽子外用。蹠疣的治療相對尋常疣更為困難，是因為局部的角質層比較厚，各種治療的穿透不佳，此外局部經常受壓，使治療後壞死的表面組織脫落不良而影響了治療。

系統藥物，對於部分大面積廣泛發病的患者，可以試用維a酸類藥物口服，比如異維a酸膠囊和維胺酯膠囊。