兒童癲癇能治癒，但並非全部均可治癒。兒童癲癇預後比成人好，能否治癒與癲癇類型以及病因有關。癲癇發作類型從病因分為原發性癲癇、繼發性癲癇、隱源性癲癇。原發性癲癇大部分與遺傳有關，經過正規抗癲癇藥物治療2-4年，然後逐漸減量到停藥，不再發作，大部分均能夠達到治癒。

繼發性癲癇當中，部分經過去除病因治療，如佔位、血管問題經過手術治療，同時結合藥物正規治療，也能夠達到治癒。約20%-30%左右癲癇病因不明，或藥物療效不好，屬於難治性癲癇，無法治癒；如嬰兒痙攣症較難控制，需要幾種藥物，也達不到完全控制，部分需要終身服藥。