腦炎是腦實質炎症病變的總稱，有不同的病因，如細菌、病毒、真菌、結核等都可以引起中樞神經系統感染性疾病。不同的腦炎，治療預後不同，文獻有報道，腦炎總體病死率約10%，但是高達50%的患者，可經歷短暫的意識或者活動障礙，20%的患者可能留有嚴重的後遺症，所以兒童腦炎主要取決於病原菌的種類，其次年齡段也很重要，如嬰兒。大部分患者是由於細菌感染引起的腦炎，腦炎的嚴重程度，如有無併發腦室管膜炎、硬膜下積液等，有無出現頻繁抽搐，跟預後密不可分。

一旦出現上述症狀，可能預後較差，也可能留下嚴重的後遺症。病毒性腦炎，尤其在夏天或者相對於大齡兒童，病毒性腦炎比較常見，除單純皰疹病毒腦炎以及乙腦等可以引起腦細胞大量壞死、出血導致嚴重併發症外，大部分病毒性腦炎相對來說預後較好。此外，還取決於腦炎發現的早晚，應早期診斷、早期治療，有時治療不充分也是導致預後不好的原因。疾病的嚴重程度與治療過程中有無併發症的發生，也是影響到患者能否治癒，是否會存在嚴重後遺症、併發症的關鍵因素。