通常不建議在月經期使用苦參凝膠，女性在月經期會出現子宮內膜脫落、宮頸口開放，血液本身是細菌培養基，因此所有陰道給藥在月經期都要暫時停止。除陰道給藥，包括陰道內檢查，比如婦科檢查、陰道B超檢查，月經期都不可以進行。

苦參本身是中藥中的清熱解毒的寒涼性藥物，月經期間由於機體免疫力低下，要儘量避免寒涼藥物對於月經的影響。月經期間要保持外陰清潔，可以每天用溫開水清洗外陰、勤換衛生巾，衛生巾儘量選擇正規廠家生產的產品，並且月經期不可以進行盆浴和坐浴，也不可以同房。