幽門螺桿菌感染會導致口臭，也是導致口臭十分常見的原因。所以對於有口臭的患者，應檢查是否存在口腔或耳鼻喉科疾病，若排除此類疾病，應考慮是否存在幽門螺桿菌感染或胃腸道疾病，可以做碳13或碳14呼氣試驗，查看是否存在幽門螺桿菌感染。對於存在幽門螺桿菌感染的患者，通常可以採用四聯14天療法進行根除治療，需注意服藥期間避免飲酒、規律服藥、避免漏服，可以減少耐藥產生，從而提高根除率。

對於合併消化性潰瘍，甚至可疑胃癌的患者，除根除幽門螺桿菌外，可能需長期繼續服用一段時間的抑酸、護胃藥物，甚至需結合外科，進行外科手術干預。幽門螺桿菌感染可以根除，但要注意治療後進行復查，確定細菌是否根除。通常複查的方法也是採用碳呼氣試驗，如果細菌得到根除，要避免再感染的情況，因為幽門螺桿菌可以經口交叉感染，所以在平時需儘量減少在外就餐，使用公筷、公勺，也可以避免在家庭中產生交叉感染。