在檢測結果上出現支原體衣原體的陽性，考慮為支原體衣原體的感染。應該進行抗感染的治療，療程一般為7到10天的時間，常用的藥物是喹諾酮類、大環內酯類、四環素類，可配合藥敏試驗選擇自身比較敏感的抗生素進行治療。

療程結束之後定期進行復查。支原體衣原體檢查結果為陰性，臨床上沒有伴隨症狀，是屬於正常的，不需要用藥物治療。