功能性消化不良的治療方法如下：

1、一般治療：建立良好的飲食和生活習慣，保持情緒平穩，心態健康；

2、藥物治療：西醫治療可使用抑制胃酸分泌藥物，或促胃動力藥物，中醫應對患者辨證後選擇對症藥物；

3、針灸治療：疏肝解鬱、活血止痛，迅速緩解胃腸不適症狀；

4、保健治療：通過揉腹，或刺激足三里等保健穴位，有效緩解消化不良症狀；

5、心理治療：部分患者可接受心理治療。