功能性消化不良是一種良性的胃腸道功能性疾病，經適當治療可得到有效控制，其預後良好。但如果未及時治療，或患者不配合治療，可能導致病情加重。所以患病後應注意飲食和生活習慣的調整，不暴飲暴食，不吃過甜、過酸和刺激性食物，進食後也不要立即彎腰或運動。同時，應保持良好的心態和愉快的心情，適當進行中醫保健等鍛鍊，緩解不適症狀，達到治癒目的，並有效防止其復發。