抗核抗體陽性通常提示患者存在自身免疫性疾病，此類自身免疫性疾病以及與自身免疫相關的不良妊娠，是影響懷孕和胎停相對較常見的病因。需根據抗核抗體陽性中含有的自身抗體進行判斷，其中抗SSA和抗SSB抗體與胎兒發育以及心臟傳導發育相關。如果患者出現上述抗體陽性，可能會影響胎兒發育，以及女性懷孕情況。

另外，如果抗核抗體陽性，可能會合並抗磷脂綜合徵疾病。抗磷脂綜合徵會易導致血栓形成，包括胎盤血栓，會導致患者反覆流產和胎停。上述情況都有一定概率可影響到懷孕和胎停，但並非每個出現抗核抗體陽性患者均會出現胎停或流產的情況。如果患者出現抗SSA、抗SSB或磷脂抗體陽性，影響到懷孕或胎停的幾率相對較高。