胚胎停育要做的是清宮術，清宮術和無痛人流的整體操作相似。胚胎停育是不正常的妊娠過程，即胚胎停止發育，是病理性妊娠，病理性妊娠不能繼續妊娠，必須清除出來，所以需要做清宮手術，而人流是對正常妊娠的終止。具體操作過程包括麻醉、消毒、檢查宮腔、進吸引器，根據胚胎著床的位置把胚胎吸出，之後進行清宮，清理蛻膜，最後觀察出血量。

術後需要進行某些觀察，如出血、腹痛、體溫等，常規術後2周進行復查，進行超聲或者加上婦科檢查。因此對於胚胎停育，需要做的是清宮手術，而正常人需要做人流手術，這是兩個概念，但是手術操作過程相似。