輔助生殖技術的雙胎率可能比自然懷孕要高點，但是雙胎危害更大，所以不建議患者以生雙胞胎為目的做試管嬰兒。由於促排卵藥物的使用和輔助生殖技術的出現，多胎妊娠率明顯增加。促排卵藥物可以促進多個卵泡同時發育和排卵，從而導致多胎妊娠的發生。輔助生殖技術中，多胎妊娠的發生與向宮腔移植多個胚胎有關。減少多胎妊娠的對策具體如下：
1、嚴格掌握促排卵藥物應用指徵，同一個週期控制1-2個主導卵泡發育排卵，從而減少多胎妊娠的發生；
2、通過減少移植胚胎數目而減少多胎妊娠的發生。衛生部在人類輔助生殖技術規範中明確規定，每個週期移植的胚胎不超過3個。
2017年中華醫學會生殖醫學分會，在輔助生殖技術行業規範指南和專家共識中推薦，對於預後良好的35-37歲的患者，建議選擇單胚胎移植。2018年12月，海南省人類輔助生殖技術指控中心建議，胚胎移植一般不超過2個。對於年齡＜35歲，首次移植的患者和有單胚胎移植指徵的患者，推薦使用單胚胎移植。