一般情況下，慢性結腸炎患者的腸道黏膜功能處於受損狀態，黏膜功能包括黏膜的吸收功能。豆漿為一種植物蛋白類飲料，於腸道內經腸道細菌分解，會產生一些氣體，最大的不適，可能會造成腹脹加重，有可能會刺激腸道蠕動加快，造成肛門排氣增多。

慢性結腸炎患者，其腸道的吸收功能降低，對於蛋白的吸收功能亦可出現下降，攝入大量豆製品或者豆漿之後，可能腸道內的產氣量會比正常的人群更多。

慢性結腸炎患者的腸壁有可能出現水腫，患者的腸道可能比其他人更薄，氣體可能對腸壁的損害更大，造成腸壁的通透性增加，會造成腸道內的細菌移位至腹腔內部，進而誘發感染。

所以建議慢性結腸炎患者儘量減少豆製品的攝入，減少豆漿類飲品的攝入，患者可以適當食用一些動物蛋白、優質蛋白。