在醫學上，慢性結腸炎不是一個準確的疾病診斷，其實慢性結腸炎包含了多種結腸的炎症性病變，如潰瘍性結腸炎、克羅恩病、結腸結核、痢疾、阿米巴痢疾等。

臨床上以腹痛和腹瀉為主要特徵。慢性結腸炎通過結腸鏡檢查可發現結直腸黏膜充血、水腫、滲出改變，即可明確診斷。