治療慢性結腸炎的藥物包括：

1.西藥：主要針對腹痛、腹瀉、黏液便的症狀，給予5-氨基水楊酸及其衍生物，如柳氮磺胺吡啶、美沙拉嗪等，應在醫生指導下選擇適合的藥物；

2.中藥：慢性結腸炎分為肝鬱脾虛型和脾腎陽虛型，應用辨證論證的方法，針對不同的證型採用相應的中藥治療。