慢性萎縮性胃炎，從病理角度而言無法治癒，但從臨床角度而言，部分侷限性、輕度的患者，可以治癒，若為廣泛性萎縮或出現腸化生不典型增生，則無法完全治癒。

並非慢性萎縮性胃炎都會出現嚴重的後果，部分患者認為慢性萎縮性胃炎，可導致胃癌的發生，實際上，慢性萎縮胃炎患者中，僅極少數患者可發生胃癌，其發病幾率較低。