消化性潰瘍主要發生於十二指腸球部及胃竇部，這些部位是消化性潰瘍發生率較高的部位。消化性潰瘍主要發病機制為胃酸分泌過多以及幽門螺桿菌感染，導致胃和十二指腸黏膜損傷。十二指腸球部及胃竇部也是幽門螺桿菌密集度較高，以及胃酸分泌較多的部位。

胃體、胃底、食管下段等其它部位，消化性潰瘍的發病率較低。消化性潰瘍好發於胃竇以及十二指腸球部，不同部位潰瘍的腹痛部位、性質、特點不同，胃潰瘍主要表現為餐前腹痛，十二指腸潰瘍主要表現為餐後腹痛。