消化性潰瘍是因為胃酸過多消化能力過強所引起的一種疾病，所以其首選治療是抑酸劑。抑酸劑是各種拉唑類的奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑等，其抑酸強度和作用時間目前最好。達喜之類的藥物作為拉唑藥物的補充，也用在潰瘍的治療。

輔助藥物，包括胃黏膜保護藥物，起到促進潰瘍的癒合，讓潰瘍癒合質量更高，縮短潰瘍的癒合時間。中成藥可以減輕胃潰瘍症狀，促進潰瘍癒合。潰瘍治療實際上是綜合治療，雖然首選治療是拉唑，但是綜合治療的飲食治療也較關鍵。