泌尿系感染與淋病，主要區別在於淋病通過性傳播進行感染，屬於泌尿系感染較為特殊的形式。若未經過不良性接觸，通常不會患淋病。泌尿系感染通常是指普通的細菌感染，可以發生於整個泌尿系統，如腎臟、前列腺、尿道以及膀胱等部位，都可能出現泌尿性感染。

泌尿系的細菌感染可能是革蘭氏陰性菌，也可能是革蘭氏陽性菌，並不通過性傳播感染，但可以通過腸道以及肛門逆行感染。淋病是泌尿系統中一種特殊感染，主要通過不良性行為傳播，只要避免不良性生活，就可避免淋病感染。