輸卵管不通不會生化妊娠，二者之間無任何關係。輸卵管不通一般為先天發育不良、炎症、子宮內膜異位症或輸卵管結核等疾病導致，生化妊娠指懷孕後胚胎在未見胎心、胎芽之前則停止發育。生化妊娠患者有時未進行查血或查尿，不知道自己懷孕，通常誤認為月經延遲。

生化妊娠的原因較多，臨床多見於偶發事件，即男方和女方均無異常，胚胎自身發育過程中的某個環節出現問題，如染色體問題導致不能正常發育，引起流產。此外，還有母體因素，如免疫、凝血、內分泌、子宮問題均可導致胚胎不能正常發育。男方，如染色體原因也可導致胚胎髮育異常，但臨床較少見。