咽喉反流和慢性咽炎的主要鑑別方法如下：

1、症狀表現：咽喉反流性疾病幾乎涵蓋整個慢性咽炎的症狀，不易區分；

2、常規檢查：包括電子喉鏡、纖維喉鏡，咽喉反流表現為口咽部黏膜慢性充血，部分咽側索肥厚，鼻咽部黏膜慢性充血，喉腔部杓狀軟骨紅斑或者水腫，黏膜水腫、充血，聲帶紅斑、增厚、白斑，喉室縮小或者閉鎖，室帶肥厚充血、代償；

3、內鏡檢查：內鏡下食道pH值監測、唾液胃蛋白酶測定；

4、診斷性治療：採用質子泵抑制劑，觀察症狀是否緩解；

5、量表評估：反流症狀指數量表也稱RSI量表。