排卵障礙不能真正治癒，治療原則是通過控制排卵障礙，治療排卵障礙帶來的問題，排卵障礙患者通常合併月經問題，甚至是異常的子宮出血，需要結合患者的年齡、生育要求、月經特點進行治療。

通常是比較年輕的女性，或者是40歲之後的女性卵巢功能減退，容易出現排卵障礙，兩者治療方式不同。當患者沒有生育要求時，治療原則就是止血、調整月經週期，如果患者有生育要求，主要治療目的是促進排卵，當排卵正常時，月經會相應正常。在排卵障礙的人群中，尤其是青少年，比較容易看到肥胖患者，在做調整月經週期及止血治療的同時，還需做生活方式的調整，做減重治療，而且要維持終身。