吸菸可能導致不孕不育，建議無論男性或女性在孕前3個月時禁菸、禁酒，改變不良生活習慣。由於菸草中含有尼古丁等有害物質，對女性卵母細胞和男性精子質量均會產生影響，長期吸菸的女性卵巢功能相較於未吸菸女性差。當卵巢功能衰竭到一定程度時，便會導致女性不再排卵，因此吸菸可能導致不孕。

不孕不育症指懷孕後容易出現胎停現象，由於吸菸會影響精子和卵子質量，若精子和卵子質量均處於極差的情況時，不易結合形成受精卵，或者形成受精卵後由於受精卵質量較差，即便偶然著床於女性子宮內膜中也無法持續發育。發育過程中胚胎停留在某個階段，在子宮內膜內死亡，稱為胎停。此類情況可導致胎兒無法順利出生，因此吸菸既可以影響懷孕概率，同時也會導致胚胎質量下降，出現胎停和流產現象。