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心內膜墊缺損的孩子根據病變類型不同，可以分為部分性和完全性，而完全性心內膜墊缺損又可以分為A型、B型和C型。每一種分型和每一種病變，病情輕重在每一個孩子身上也各不相同，而手術的費用又與孩子的病情和術後恢復是否順利有很大的關係。而對於部分 性心內膜墊缺損而言，如果術後恢復順利，一般會花費大概4萬元左右；如果是完全性心內膜墊缺損，做了一期根治，術後又恢復順利，則可能需要花費6-8萬元；而對於恢復有困難或者是病情比較重的孩子，可能花費偏多，可能達到8-10萬元。總體來說，心內膜墊缺損這種疾病存在很大的個體差異性，每個孩子的手術效果和花費也各有差別。
心內膜墊缺損是一個複雜的先天性心臟病。這類疾病根據不同的分型，預後也不一樣。心內膜墊缺損最簡單的一型是原發孔房間隔缺損，這一類手術預後比較好。涉及到二尖瓣瓣裂、三尖瓣瓣裂甚至於是十字交叉消失的心內畸形就比較嚴重。手術時間長，手術的 步驟也比較複雜。這一類分型的患兒手術以後仍然會面臨到圍手術期出現心臟功能不全、呼吸功能不全，甚至於出現低心排等比較嚴重的併發症危及生命，所以心內膜墊缺損的預後根據不同的分型不一樣，比較嚴重的分型預後也比較差。容易因為出現嚴重的併發症而導致患兒死亡。心內膜墊缺損手術治療以後還有一些問題需要注意，特別是對於先天性複雜型的心內膜墊缺損，手術治療以後特別注意避免各種加重心臟功能心臟負擔的因素，比如液體攝入過多，活動量過大，這類患兒在術後以後要儘量的多休息。作為家屬要避免小孩哭鬧，避免攝入過多，定期複查心臟功能，如果出現比如雙下肢水腫、小兒嘴唇發紫、甚至於是雙眼瞼水腫這些問題都要及時到醫院就診。