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頸動脈斑塊手術沒有百分之百安全，且手術或多或少會產生併發症，患者可選擇有經驗的醫生或醫療團體、治療中心，以降低併發症的發生率。頸動脈斑塊手術包括開放式手術及介入微創手術，術後共同的併發症主要是缺血性腦卒中及腦出血，病情較重， 可引起明顯的後遺症，如半身不遂、失語等，而其它的小的併發症，其發生率較前者相對較高，但易處理，不易引起明顯的後遺症。
頸動脈斑塊的手術方式主要分為微創手術和開放式手術，其手術時間需根據患者的病情及手術方式而定，如患者無明顯的嚴重併發症或複雜的解剖變異，則微創手術的平均治療時間約30min-1h。由於開放式手術涉及麻醉，故其手術時間相對較長，平均治療時間約1h-2h；如患者病情複雜，有明顯嚴重的合併症或血管形態及解剖結構異常，則其手術時間相對延長，因人而異。
頸動脈斑塊手術患者的住院時間需根據其病情的嚴重程度及術後的恢復情況而定，因人而異，無明確的規定期限。如患者病情簡單，術前無特殊檢查，術後無明顯嚴重的合併症及併發症，通常其手術住院時間約需一週；如患者病 情複雜，有嚴重的合併症及併發症，則術前需予以充分評估，完善相關檢查，其住院時間可能需7-10天，甚至更長。
頸動脈斑塊的手術費用取決於具體的手術方式及地區。由於介入微創手術需植入支架，其費用與開放式手術相比，相對較高。以北京市為例，單純的頸動脈斑塊的微創手術費用約5-6萬元左右，去除報銷部分，患者需自費3.5-4萬元左右。開放式手術的費用常低於1萬元，去除報銷部分，患者可能需自費1-2千元。如患者病情複查或合併有較嚴重的併發症，其費用可能增加，具體不定。