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對於男性尿道結石，如果在5mm以下，通過多喝水、多活動，大量排尿，大部分結石可以排出。如果不能排出，可以應用部分抗生素，減輕尿道的炎症水腫，也可以排出。如果依然不能排出，需藉助膀胱鏡或輸尿管鏡，經尿道外口觀察尿道內結石後，利用激光進行粉碎並排出體外，也可以利用彈道碎石將結石粉碎以後排出體外，還可以選擇用碎石鉗將結石夾碎以後排出體外。
女性尿道結石治療的方法，主要考慮體外碎石或體內碎石。尿道結石通常指的是泌尿系統結石，即腎臟、輸尿管、膀胱、尿道等結石。真正的尿道結石多發生於男性，女性的尿道因為較短，且如果結石進入尿道，多數可自然排出，所以尿道結石多指輸尿管結石。
尿道結石不屬於較嚴重的疾病，並且不會存在危險，威脅患者的健康。通常95%以上的泌尿繫結石，包括輸尿管結石、膀胱結石、尿道結石，都是由腎結石在向外排的過程中發生，不屬於原發疾病。尿道結石由腎臟產生，經過輸尿管、膀胱所形成，較容易得到診斷。
尿道結石碎石後，一般在碎石過程中就會將結石取出來，或者當時就會排出。如果做輸尿管鏡下的激光碎石，大多數結石在手術中被衝出，殘留部分小碎石可能在手術後才會慢慢排出。因為小碎石被衝到腎盂或者留在膀胱裡，一般1-3天后 會陸續排出。
尿道結石指結石位於尿道或膀胱以下，前尿道結石通過血管鉗直接夾出，後尿道結石可在尿道鏡下推至膀胱內，再進行碎石治療或使用能量器械，如激光、氣壓彈道等碎石治療。較為常見的是輸尿管結石，輸尿管是腎臟與膀胱間的細長組織，長約20cm，直徑約3-4mm，為結石排出後易卡頓 處。