再生障礙性貧血的患者，可以應用免疫抑制劑治療，例如環孢素，抗淋巴細胞球蛋白，抗胸腺細胞球蛋白等。另外，還可以用雄激素治療如司坦唑醇等。對於重型再障的患者，還可以做異基因造血幹細胞移植治療。另外就是給予對症支持治療，感染的給予抗生素治療，貧血、血小板減少的，給予輸注紅細胞以及血小板治療。最後還可以應用中醫中藥治療，例如再造生血片等。