白細胞減少症最主要的危害就是容易發生感染。如果是輕度的白細胞減少，一般的臨床缺乏特異的症狀，起病比較緩慢，有的患者有乏力，疲倦，頭暈，食慾減退，失眠，心悸，低熱等症狀。如果白細胞明顯減少，往往合併明顯的感染，出現突發的寒戰高熱，頭痛，全身肌肉或者是關節疼痛，虛弱衰竭等症狀。並且感染不容易控制，迅速惡化並且蔓延，引起肺部感染，敗血症，膿毒血癥等可以導致致命性的感染。