膜增生性腎小球腎炎傳統上是根據電鏡檢查分為I型，II型，III型。但是進一步認識到膜增生性腎小球腎炎發病機制後，目前已重新分類為免疫複合物介導型，補體調節機制異常導致補體旁路途徑持續活化型，非免疫球蛋白和補體沉積介導型這三型。最後一型較罕見。免疫複合物介導型的膜增生性上球腎炎的特徵是存在免疫複合物後補體成分，可見於慢性感染，自身免疫性疾病和單克隆免疫球蛋白。補體介導的膜增生腎小球腎炎的特徵是僅有補體成分，沒有免疫複合物沉積，又分為C3腎小球病和C4腎小球病。