狼瘡腎炎的治療包括免疫抑制治療和針對相關表現和併發症的支持治療。避免過多的紫外線暴露，避免過度疲勞，避免應用腎毒性藥物。羥氯喹可以預防狼瘡腎炎的發生、復發，延緩終末期腎臟病的發生。狼瘡腎炎常用的免疫抑制治療包括糖皮質激素聯合細胞毒藥物或其他免疫抑制藥。細胞毒藥物有環磷酰胺、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤、來氟米特等等。