手指類風溼性關節炎的發病原因尚未完全明確，可能環境因素、遺傳因素以及免疫紊亂為手指類風溼性關節炎發生的主要原因。環境當中的直接感染因子是手指類風溼性關節炎發生的重要原因，家族性的遺傳因素也與手指類風溼性關節炎密切相關，免疫的紊亂導致抗類風溼因子作用的減弱。總的來說，手指類風溼性關節炎的發生是三種因素綜合作用下的結果。
一、主要病因
1、環境因素：目前未證實有導致手指類風溼性關節炎的直接感染因子，但目前認為一些感染如細菌、支原體和病毒等可能通過感染激活相關的淋巴細胞，分泌致炎因子，產生自身抗體，從而影響到發病和病程的進展。
2、遺傳易感性：根據大部分患者的信息調查顯示，手機類風溼性關節炎的發病與家族遺傳因素密不可分。有1/10的患者表示其直系親屬患有或曾患上過該病，充分表明該疾病的遺傳傾向還是相對較大的，也可能是其與環境因素共同作用的結果。
3、免疫紊亂：免疫系統的紊亂是手機類風溼性關節炎的主要發病機制，致病細胞對關節和滑膜的浸潤，導致疾病的發生。此外，致病的細胞還會導致自身的抗風溼因子的合成受影響，從而造成自身對其抵抗力下降，也是導致該病遷延不愈，比較難以根治的原因。同時該細胞分化為漿細胞，分泌大量免疫球蛋白，形成免疫複合物之後，誘發炎症。
二、誘發因素
1、生活環境或工作因素：日常的生活環境相對潮溼，或者工作環境不是很好，也是誘發手指類風溼性關節炎的重要原因之一。這樣的環境當中致病因子感染的幾率遠高於其他環境，同時患者自身不注意調節，進而導致出現的早期徵兆被忽略，耽誤了病情，使其進一步加重後，也給治療上帶來了麻煩。
2、前期治療不當：手指類風溼性關節炎前期也是有相應的早期症狀的，如關節隱痛不適或者屈伸不利、功能障礙等相關表現，而有些患者往往並不覺得這是疾病，而是認為是自己過於勞累導致的，因此也不去做相應的檢查和治療，慢慢拖延，耽誤了病情，使得其進一步加重後，更加難以治癒。