幼年血清陰性脊柱關節病一般需要服用非甾體類抗炎藥物，主要包括布洛芬、萘普生或者雙氯芬酸鈉，緩解關節疼痛症狀。另外對於一些患兒，還需要考慮服用柳氮磺胺吡啶或者甲氨蝶呤治療。對於僅有膝關節和踝關節等大關節受累的患兒，還可以考慮關節內注射激素緩解症狀。除了藥物治療以外，平時的康復鍛鍊也是非常重要的，另外平時注意進行飲食指導，避免出現生長發育障礙。