血清陰性脊柱關節病常見病因有以下幾種：第一、先天性遺傳因素，有家族史的患者發病率為正常人群的20倍以上，88%以上的患者血清組織相容性抗原HLA-B27陽性，而其一級親屬HLA-B27陽性率為50%以上，因此遺傳因素是血清陰性脊柱關節病重要病因。第二、感染以及自身免疫功能障礙、環境因素，均是血清陰性脊柱關節病的重要病因，以上因素可以造成HLA-B27陰性患者發生血強直性脊柱炎，通常與免疫功能發生紊亂有關。