蟯蟲病的治療藥物可以選用阿苯達唑頓服，12歲以下兒童劑量需要減半。因為蟯蟲病容易復發，兩週後需要重複服藥一次，兩歲以下的小兒禁用。還可以服用甲苯米唑，四歲以下小兒劑量需要減半，間隔2-4周分別需要重複服藥一次，以防復發。
還有恩波維銨等藥物可以選用，服用方法及注意事項需要遵醫囑。蟯蟲病容易復發，預防很重要，每晚和清晨要清洗肛門及其周圍皮膚，並換洗內褲，以及換下的衣服要煮沸消毒，注意個人及環境衛生，養成良好的衛生習慣，飯前、便後都要洗手，以及勤洗澡、不吸吮手指，玩具可以用紫外線或者日曬消毒。