右側輸尿管結石和不典型急性闌尾的區別，可通過以下幾個方面加以鑑別診斷：
一、病史，急性闌尾炎的病史會有典型的轉移性右下腹痛，即疼痛開始時位於上腹部，隨著時間的進展逐漸轉移至並固定於右下腹。而輸尿管結石，一般疼痛開始於右側的腹部和腰部。
二、疼痛的性質，急性闌尾炎開始疼痛時一般疼痛性質較輕，隨著時間的進展會逐漸加重。而輸尿管結石的疼痛開始時即較為嚴重，但中間有間歇期。
三、輔助檢查可通過右下腹闌尾彩超或CT，以及泌尿系的彩超或泌尿系平片加以鑑別診斷。另外，輸尿管結石一般尿常規會有白細胞，及紅細胞明顯的升高及血尿，而急性闌尾炎血常規會有明顯升高，以及白細胞、中性粒細胞會有相應的升高。