腸胃感冒通常是由呼吸道合胞病毒、鼻病毒、腺病毒等感染上呼吸道，同時引起胃腸道功能異常。在治療上通常沒有特殊的方法，一般也不需要抗病毒治療，但對於免疫力低下的病人，可以適當選擇利巴韋林、奧司他韋等抗病毒藥物。如果患者出現嚴重的嘔吐，可以適當口服甲氧氯普胺進行止吐，腹瀉嚴重的患者需要使用蒙脫石散進行止瀉，同時要注意補液，防止水電解質紊亂。
高熱的患者，體溫超過38.5℃時，可以使用非甾體類的退熱藥物，如布洛芬或者對乙酰氨基酚，在退熱的同時，要注意熱退大汗後的虛脫反應。