單純從名稱上來區分，可以明確，胰腺囊腫多數屬於良性疾病，胰腺癌屬於惡性疾病，而且臨床觀察，前者一般包括真性囊腫、假性囊腫、囊性腫瘤，而後者則是消化系統常見腫瘤，死亡率極高。所以它倆的一個區別就在於，是否會發生轉移。臨床表現也可以發生不同，前者主要可以影響胰腺的內分泌功能，出現拉肚子、血糖異常表現，而胰腺癌則除了有消化系統一些表現外，還會出現腹痛，嘔吐，嘔吐物可呈淡紅色，消瘦等。彩超等影像學檢查表現可以有不同。