異常凝血酶原高不一定是出現了原發性肝癌，雖然絕大多數的肝癌患者，都會出現異常凝血酶原高，但這並不是肝癌的特異性表現，不能作為本病的確診依據，其它疾病也可引起異常凝血酶原升高。異常凝血酶原是指機體在缺乏維生素K的情況下，肝細胞不能合成正常的依賴維生素K的凝血因子，只能合成無凝血功能的異常凝血酶原。除了肝癌，異常凝血酶原升高的常見原因還有以下兩大類：
1、維生素K缺乏症的患者，因維生素K是合成凝血因子的輔酶製劑，當維生素K缺乏時，人體就無法合成正常的凝血因子，而只能合成異常的凝血因子，因此就導致了異常凝血因子水平升高。
2、其它慢性肝病的患者，由於肝臟合成凝血因子的功能下降，這時就只能合成非正常的凝血因子，也就是出現了異常的凝血酶原。