肝門膽管是惡性程度非常高的一種消化道腫瘤預後非常差，大部分的患者生存期在1年左右，但是具體能夠存活的時間還需要根據肝門膽管癌的分期，是否引起了嚴重的併發症以及治療方案而定。對於早期的肝門部膽管癌，如果能給予根治性切除，還有可能明顯延長生存期。但是對於晚期的肝門部膽管癌，患者容易出現反覆發作的膽管炎，甚至是膽道出血，患者有可能在1-3個月內就出現死亡