對於胃鏡診斷明確的消化性潰瘍，消化性潰瘍包括十二指腸球部潰瘍和胃潰瘍。首先，要區分是否有幽門螺桿菌的感染，如果有幽門螺桿菌的感染，要抗幽門螺桿菌治療。
在幽門螺桿菌治療結束後給予2-4周的抑制胃酸分泌的治療，是否需要維持治療，根據潰瘍復發的頻率、年齡和是否服用恩賽類藥物、有沒有吸菸、有沒有合併其它併發症來做臨床的綜合考慮。如果內科治療沒有效果，有急性穿孔、急性大出血或者是瘢痕性的幽門梗阻，內科治療治療無效的頑固性潰瘍，或者是胃潰瘍懷疑有癌變，這類的人群建議要考慮外科手術治療。