腦膿腫首先會有急性感染的全身中毒症狀，比如可以出現突然的發熱、畏寒、頭痛以及噁心嘔吐，也可以出現肌肉痠痛，伴有頸部強直。隨著膿腫的形成和逐漸增大，可以引起周圍腦水腫導致顱內壓增高，表現為頭痛症狀加重以及頻繁的嘔吐和噁心，甚至出現噴射樣嘔吐。還可以導致出現精神的異常，表現為表情淡漠、反應遲鈍、煩躁不安等。此外還可以誘發癲癇，出現反覆的肢體抽搐。