不是所有的顱內動靜脈畸形手術後都會遺留後遺症，後遺症取決於畸形團大小、部位和手術方式。如果畸形血管團比較小並且位於非功能區，無論進行開顱手術還是介入手術都沒有後遺症。如果畸形血管團位於腦重要功能區，手術會遺留偏癱、失語、視野缺損、視力下降、肢體麻木、癲癇發作等後遺症；如果畸形血管團未完全清除，會遺留再出血、癲癇等後遺症。