治療泌尿繫結石的手段方法很多，包括保守治療、藥物排石治療，甚至手術治療、體外衝擊波碎石治療等等，需要針對不同的結石的大小及部位，來選擇不同方式的治療方案，常見如下：
1、保守治療：一般來說對於6mm以下的泌尿繫結石，通常可以建議患者行保守的排石治療，口服排石或者溶石的藥物，然後再口服擴張輸尿管的藥物，通常都能夠使6mm以下的結石順利地排出體外；
2、體外衝擊波碎石：如果患者合併有輸尿管的狹窄或者梗阻，或者尿道狹窄梗阻等，這樣可能即使結石再小，也不一定能夠排出體外，所以這時候患者可能要行手術治療，如果結石在6mm-1cm以內，尤其是上尿路就是腎盂輸尿管結石，可能手術治療方案就更加靈活，既可以採用體外衝擊波碎石，但這一類可能對於結石較軟的患者來說比較合適，尤其是對於腎盂內或者輸尿管上段的結石；
3、輸尿管鏡手術：如果對於輸尿管中段或者下段的6mm以上的結石，通常建議採用輸尿管鏡的手術，或者輸尿管軟鏡的手術來治療；
4、腹腔鏡輸尿管切開取石：如果輸尿管黏膜炎症狹窄較重，息肉增生明顯，同樣可以採用腹腔鏡輸尿管切開取石的方法來治療，也能夠達到比較好的治療效果；
5、經皮腎鏡手術：再有對於1cm以上，尤其是2cm以上的結石，在腎內的結石可以採用經皮腎鏡的手術方式，就是從腰上穿刺進入腎盞建立通道，將結石擊碎然後吸出，這是對於上尿路結石。
對於下尿路結石來說，主要是膀胱結石，對膀胱結石一般的手術方式就是比較單純，就是經尿道的將膀胱結石擊碎，然後取出體外。但是對於下尿路結石來說，一般都不是原發的通常都是繼發的改變，也就是繼發於比如說膀胱出口梗阻，或者良性前列腺增生導致尿液瀦留，引起的結石形成。所以在處理了膀胱結石以後，仍然要進一步處理增生的前列腺體，達到治標又治本的效果。