糠酸莫米乳軟膏通常不建議使用於龜頭炎的治療，大多數龜頭炎通常是包皮垢刺激引起的細菌、真菌或者支原體、衣原體等微生物的感染。這種情況下在臨床上大多數是使用抗細菌或者抗真菌的外用藥膏，如百多邦、匹得邦、美多信，或酮康唑軟膏等來進行治療。
糠酸莫米松乳膏通常是一種糖皮質激素類藥物，它對於溼疹或者神經性皮炎治療效果比較好。對於包皮龜頭炎，通常使用效果並不好，而且長期使用可能會有一定的副作用，因此不建議首選使用於包皮龜頭炎。在臨床上對於藥物的使用，應在專科醫生指導下根據病情的需要來進行選擇。