氧氟沙星軟膏可以應用於包皮龜頭炎的治療，但是僅限於少部分患者。
因為在包皮龜頭炎的發病當中有多種病原微生物，需要根據病原微生物的不同來進行選擇，氧氟沙星主要是一種殺菌劑，針對的是細菌感染，但是在包皮龜頭炎的感染當中，細菌感染所導致的包皮龜頭炎，其主要的細菌是金黃色葡萄球菌，也就是革蘭氏陽性菌，大概佔了80%，而革蘭氏陰性菌大概佔了20%，氧氟沙星軟膏主要針對的是革蘭氏陰性菌。在治療當中對於細菌感染所導致的包皮龜頭炎，主要選擇的外用藥物還是要針對革蘭氏陽性球菌的藥物，小部分革蘭氏陰性菌感染的患者可以選擇氧氟沙星軟膏進行治療。