睪丸炎早期的治療方法就是要使用強有力的抗生素進行治療，經常選的抗生素是喹諾酮類抗生素，常用的藥物有左氧氟沙星。喹諾酮類抗生素本身高效、低毒，而且在泌尿生殖系統中有效殺菌物質含量比較高，所以一直以來都應用於泌尿生殖系統的感染，包括睪丸炎的首選抗生素藥物。
如果患者小於18歲，喹諾酮類抗生素會影響孩子的骨骼發育，這時候可以選擇用頭孢菌素類抗生素代替，常用的藥物有頭孢克洛。在治療期間鼓勵患者多飲水，不要喝酒，不要吃過於辛辣的食物。