前列腺炎分成兩種，一種是細菌性前列腺炎，另一種是非細菌性前列腺炎。細菌性前列腺炎治療的藥物最主要的就是抗感染治療，就是抗生素類的藥物。對於前列腺包膜比較厚，藥物比較難滲透的這個器官，抗感染的藥物或者抗生素，最常用的有喹諾酮類抗生素、大環內酯類抗生素、氨基糖苷類抗生素，還有頭孢菌素等抗菌素。
抗生素治療要注意，療程要足夠，劑量要足夠，才能達到殺死前列腺裡感染致病菌的作用。如果在抗感染的基礎上，症狀又比較重，還可以用緩解症狀的藥物。
非細菌性的前列腺炎主要是針對症狀進行治療，也就是用緩解症狀的藥物。緩解症狀的藥最常用的是α受體阻滯劑，這個是針對尿頻、尿急、尿不盡、尿線變細、尿分叉，還有夜尿次數多進行治療的。最後是植物製劑的藥物，包括中成藥，還有國外進口的花粉製劑類的藥物，幫助消除非特異性炎症，這些都是常用於治療非細菌性前列腺炎的藥物。