精囊炎往往急性期好治，慢性期難治。如果急性期治療不徹底很容易日久遷延形成慢性，臨床上可以見到頑固性血精的現象。急性期通過加上抗感染治療一般兩週左右可以治癒。如果進入慢性期，治療週期將會很長，三個月或者半年。對於那些反覆半年以上的，常常需要通過精囊鏡手術治癒。另外，由於精囊和前列腺相鄰，再加上精囊以射精管為出口，出口狹窄時有發生，這些都可以導致精囊炎的治癒時間延遲。