前列腺囊腫通常沒有明顯的臨床症狀，尤其是一些較小的前列腺囊腫，在臨床上無需特殊治療，隨診觀察即可。但是，對於較大的前列腺囊腫，有可能會出現臨床症狀，表現出尿急、尿頻、排尿費力、尿線細、尿瀦留等，壓迫尿道產生疼痛，壓向直腸時可引起排便困難，這種情況下可能需要相應的治療。
前列腺囊腫是一種良性疾病，在臨床上可能是由於前列腺上皮、腺小管堵塞等原因所造成，通常需要跟前列腺的腫瘤相鑑別，如前列腺癌等疾病。