胃食管反流有生理性的和病理性的，如果是生理性的，隨著年齡的增長，反流比較輕可以自愈的，尤其是有些孩子因為剛剛出生，年齡越小，胃腸功能越不成熟，再加上組織發育也沒有完善，所以常常會出現胃食管反流。隨著年齡的增長，再加上注意平時的護理，大多數都會自愈的。
如果是病理性的胃食管反流就不能自愈了，要經過消化科進一步的檢查，然後確定反流的性質，然後再進行綜合的評估，可以藥物治療，有些嚴重的胃食管反流可能還需要手術治療。